人體腸道內有上兆的細菌數，種類非常多，有好菌、也有壞菌，這就是所謂的「腸道內細菌多樣性」，其中壞菌會讓人體發炎、生病，而好菌則幫助消化、對抗發炎、促進健康。一般而言，腸道內細菌多樣性增加，代表好菌的菌種與數量增加，是腸道健康的表徵，維持腸道內的細菌達到多樣性及好壞細菌的平衡，對身體健康有益。
吃下肚的食物內容成分，會影響腸道內細菌的多樣性，富含纖維素的食物會促進好菌生長，同時壓抑壞菌數量，對健康有正向的幫助。雖然個人先天因素(如基因、年齡)無法改變，但是可以藉由良好的飲食習慣，調整腸道細菌的多樣性，讓身體更健康。
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茶與咖啡可以維護腸道健康
荷蘭格羅寧根大學的研究團隊，收集荷蘭地區1,135位民眾的飲食習慣資料(包含茶、咖啡、紅酒與藥品等)，並從這些民眾的糞便中取得腸道內細菌的去氧核醣核酸(DNA)做定序分析，再將飲食習慣與DNA定序出的大量資料做比對，發現茶、咖啡、優酪乳與脫脂牛奶對維持腸道裡的好菌數量有幫助，也就是能促進及增加腸道細菌的多樣性；相對的，全脂牛奶和高熱量(高糖、高油)食物則會破壞細菌的多樣性。研究成果刊登於2016年4月29日的《科學期刊》(Science 2016；352：565-569)。
茶與咖啡可降低罹患心血管疾病與糖尿病的機會
茶品含有數種多酚類，咖啡則有豐富的綠原酸(一種多酚類)。以多酚(包含綠原酸)為食物的腸道內細菌，將多酚類物質代謝後，產生具有生物活性的代謝物，可以降低罹患心血管疾病與糖尿病的機會，所以多酚類(包含綠原酸)一直被認為對人體健康有幫助。
英國雷丁大學的研究團隊，利用人類糞便來探討咖啡中的綠原酸對腸道內好菌生長的影響，發現綠原酸可以促進雙歧桿菌類、梭菌類及真桿菌類等細菌(腸道內的好菌)增生，且綠原酸濃度愈高，好菌增生的效果愈顯著，這種增加特殊菌種數量的效果將有助宿主的健康。此研究結果刊登於2015年3月26日的《英國營養學雜誌》期刊(British Journal of Nutrition 2015;113:1220-1227)。
喝茶會改變女性的表觀遺傳
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「表觀遺傳」是在沒有改變染色體內去氧核醣核酸(DNA)序列的狀態下，經由某些調控機制(例如：將DNA序列上的核酸鹼基甲基化)來改變特定基因的表達或不表達，繼而引起細胞功能的表現或不表現，導致健康狀態改變(生病或變得更健康)。「表觀遺傳」與遺傳沒有直接關係，而環境、飲食習慣與生活方式等因素都會影響表觀遺傳的改變。
瑞典烏普薩拉大學的研究團隊，針對瑞典、荷蘭與義大利的部分居民共3,096人，進行大規模的DNA序列上核酸甲基化測定，分析飲食習慣造成表觀遺傳變化的情形，發現女性喝茶習慣會導致體內的某些特定基因(例如：雌激素代謝作用的相關基因)發生表觀遺傳的變化，繼而降低體內雌激素的濃度；相對的，男性喝茶似乎不會發生表觀遺傳的變化。研究成果刊登於2017年8月15日的《人類分子遺傳學》期刊(Human Molecular Genetics 2017；26：3221–3231)。這篇論文也提及，此研究結果可以更進一步推測，女性喝茶有減少乳癌發生機會的可能性。
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茶與咖啡可降低罹患心血管疾病與糖尿病的機會
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英國雷丁大學的研究團隊，利用人類糞便來探討咖啡中的綠原酸對腸道內好菌生長的影響，發現綠原酸可以促進雙歧桿菌類、梭菌類及真桿菌類等細菌(腸道內的好菌)增生，且綠原酸濃度愈高，好菌增生的效果愈顯著，這種增加特殊菌種數量的效果將有助宿主的健康。此研究結果刊登於2015年3月26日的《英國營養學雜誌》期刊(British Journal of Nutrition 2015;113:1220-1227)。
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